Иттоки Сакураба был обычным парнем, пока однажды его жизнь не перевернулась вверх дном! Однажды, он узнаёт, что является девятнадцатым наследником известного клана ниндзя — Ига. Им противостоит клан Кога, который хочет отнять жизнь у Иттоки. И теперь ему необходимо стать сильнее, чтобы защитить не только себя, но и всю свою деревню. Для этого он поступает в академию Кокутэн, где постигает ремесло современных ниндзя. Вместе с учениками из других деревень Иттоки вступает в противостояние с кланом Кога, чтобы раз и навсегда покончить с этой враждой.