Любимым занятием тринадцатилетней девочки Аобы Цудзаки всегда было сборка моделей новейших боевых роботов. Но внезапно бабушка, воспитывавшая Аобу с самого рождения, умерла. Что делать маленькой, беззащитной девочке, оставшейся один на один с этим жестоким миром? Решение приняли за неё: неизвестные увозят Аобу на секретную военную базу в Венесуэле, где производят гигантских роботов-воинов. Пилотом одного из этих могучих человекообразных роботов – Морибито 2 - предстоит стать 13-летней девочке, чтобы вместе с остальными отражать нападения агрессоров – боевых машин Дзинко. Кому выгодна эта новая война?..